Artritis periférica: Se caracteriza por oligoartritis asimétrica que predomina en miembros inferiores, si bien pueden comprometerse manos y pies.
En la enfermedad de Crohn son más frecuentes que en la colitis ulcerosa las manifestaciones extraintestinales como eritema nodoso, estomatitis, uveítis, y pioderma gangrenoso. En estos pacientes hay mayor incidencia de artritis periférica, ésta puede ser transitoria o tornarse crónica y destructiva.

La aparición de artritis especialmente en la colitis ulcerosa, frecuentemente se relaciona con la reagudización de la enfermedad intestinal. En el Crohn las manifestaciones articulares pueden preceder a los síntomas intestinales.
Las entesopatías es un hallazgo común de las espondiloartropatías, y la localización más frecuente en estos pacientes es la inserción del tendón de Aquiles y de la fascia plantar en el calcáneo.

Compromiso axial: La frecuencia de sacroileítis y espondilitis está aumentada en los pacientes con enfermedades intestinales inflamatorias y su prevalencia se estima en 5 a 12%. El cuadro clínico es semejante al de la espondilitis anquilosante. Los pacientes si bien se quejan de dolor lumbar, podrían llegar a tener también dolor torácico o cervical, y limitación de su movilidad con reducción de la expansión torácica.
A diferencia de la artritis periférica el curso clínico de las articulaciones axiales es independiente del de la enfermedad intestinal, tanto es así que la cirugía de la colitis ulcerosa y del Crohn no alteran el curso de la espondilitis asociada.